Sede

Messina

Laboratorio/

Strumento

Laboratorio MAMB

Servizi erogati

Analisi della comunità microbica mediante fingerprinting molecolare

Descrizione

Ibridazione in situ (FISH e CARD-FISH) con sonde oligonucleotidiche specifiche

Attrezzature

utilizzate

- Microscopio ad epifluorescenza

- Incubatori

- Apparati da filtrazione

Responsabile /

Contatto

Dr. Angelina Lo Giudice e Sig.ra Giovanna Maimone

Tel: + 39 090 6015414

E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it - giovanna.maimone AT cnr.it

Sede

Messina

Laboratorio/

Strumento

Laboratorio EcoBIM

Servizi erogati

Analisi del genoma microbico

Descrizione

Estrazione del DNA da colture pure.

Ricostruzione dell’intero genoma mediante:

- Assembly del genoma de novo o reference guidato

- Visualizzazione grafica delle variazioni

- Analisi degli effetti delle varianti sulla funzionalità proteica (predizione in silico)

Identificazione di Single Nucleotide variants (SNVs) e piccole indels (inserzioni e delezioni di basi)

Annotazione strutturale e funzionale del genoma mediante:

- Identificazione di protein coding genes

- Identificazione di rRNA e tRNA

- Identificazione di eventuali elementi ripetuti e trasponibili nel genoma

- Produzione di GFF e BED files

Attrezzature utilizzate

- Cappa a flusso laminare

- Autoclave per sterilizzazione

- Sistema produzione acqua pura

- Microcentrifughe

- Incubatori

- WorkStation e utilizzo di softwares “gold standards”

Responsabile/

Contatto

Dr. Angelina Lo Giudice

Tel: + 39 090 6015414

E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it 

Sede

 Messina

Laboratorio/

Strumento

 Laboratorio HydroChem

Servizi erogati

 Analisi dei nutrienti, pH e O₂

Descrizione

 Determinazione dei nutrienti (ammoniaca, nitriti, nitrati e fosforo sia disciolto che totale)

 Misure di pH

 Misure di Ossigeno Disciolto

Attrezzature utilizzate

 Spettrofotometro Varian Cary 50 UV/VIS, pHmetro, buretta digitale per titolazione ossigeno   disciolto

Responsabile/

Contatto

 Dr. Filippo Azzaro

 Tel: + 39 0906015419

 E-mail: filippo.azzaro AT cnr.it

Sede

 Padova

Laboratorio/

 Strumento

 PC e ns banca dati

Servizi erogati

 Interpretazione dei tracciati SPME/GC/MS registrati secondo ns indicazioni al fine di   verificare   la  presenza di acceleranti della combustione. Inoltre, si fornisce supporto   chimico-   documentale   su sostanze potenzialmente di interesse nell’innesco di incendi sia   dolosi che   spontanei.

Attrezzature utilizzate

  Esperienza maturata in 25 anni di applicazioni nel settore, studiando oltre 700 incendi

Responsabile/

Contatto

 Dr. Alberto Sturaro 

 Tel: +39 0498295664 / +39 3382119457 

 E-mail: alberto.sturaro AT cnr.it

Sede

 Venezia

Laboratorio/

Strumento

 Laboratorio di Spettrometria di Massa (SpeM) / EA Elemental Analyzer

Servizi erogati

 Liofilizzazione del campione

 Pesatura del campione in capsule di stagno/argento

 Analisi di:

Carbonio totale (TC);

Azoto totale (TN);

Carbonio organico (OC);

 La tempistica con cui si eseguiranno le analisi sarà concordata con il Responsabile

Attrezzature utilizzate

  Liofilizzatore Lio5P

  EA Elemental Analyzer Flash2000HT Thermo Scientific con doppia fornace, due                            autocampionatori per solidi

Responsabile/

Contatto

 Dr. Clara Turetta

 Tel: +39 041 234 8947

 E-mail: clara.turetta AT cnr.it

Sede

 Venezia

Laboratorio/

Strumento

 Laboratorio di Spettrometria di massa ad alta risoluzione (SpeM)

Servizi erogati

 Analisi elementare (a livello di ultra-tracce) di campioni ambientali.

 La tempistica con cui si eseguiranno le analisi sarà concordata con il Responsabile

Attrezzature

utilizzate

 Thermo Scientific Element XR (Thermo Scientific™ Element™ Series HR-ICP-MS)

Responsabile/

Contatto

 Dr. Giulio Cozzi

 Tel: +39 041 2348935

 E-mail: giulio.cozzi AT cnr.it

Sede

 Venezia

Laboratorio/

Strumento

 Laboratorio di Spettrometria di Massa Organica

Servizi erogati

 Sviluppo di metodi IC-MS per la determinazione di composti ionici su matrici ambientali   (sedimenti,  suoli, acque, aerosol, neve e ghiaccio), biota, materiale vegetale, preparati industriali   e per farmaceutica

 Preparazione del campione anche sotto cappa a flusso laminare

 Estrazioni con ultrasuoni o mediante estrattore a solvente Dionex™ ASE™ 350

 La tempistica con cui si eseguiranno le analisi sarà concordata con il Responsabile

Attrezzature utilizzate

   Cromatografo ionico (Thermo Scientific™ Dionex™ ICS-5000, Waltham, US) accoppiato a uno         spettrometro di massa a singolo quadrupolo (MSQ Plus™, Thermo Scientific™,                                 Bremen, Germany)

Responsabile/

Contatto

 Dr. Elena Barbaro

 Tel: + 39 041 234 8545

 E-mail: elena.barbaro AT cnr.it