6 - Analisi metagenomiche

Sede

Messina

Laboratorio/

Strumento

Laboratorio EcoBIM

Servizi erogati

Analisi metagenomiche

Descrizione

Estrazione di acidi nucleici (DNA/RNA) da differenti matrici ambientali biotiche e abiotiche; analisi metagenomica target e whole genome mediante:

- Classificazione delle specie allineando le reads al database

- Analisi OTU clustering first o assignment first

 - Analisi filogenetica

- Analisi comparative tra campioni

Attrezzature utilizzate

- Cappa a flusso laminare

- Autoclave per sterilizzazione

- Sistema produzione acqua pura

- Microcentrifughe

- Incubatori

- Celle per elettroforesi su gel

- WorkStation e utilizzo di softwares “gold standards”

Responsabile/ Contatto

Dr. Angelina Lo Giudice

Tel: + 39 090 6015414

E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it

 

 

 

 

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Laboratorio di Biogeochimica Microbica (BiogeM)

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Strumentazione disponibile

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