Sede

Messina

Laboratorio/

Strumento

Laboratorio EcoBIM

Servizi erogati

Analisi del Trascrittoma

Descrizione

Estrazione del RNA da colture pure

Analisi del trascrittoma mediante:

- Assembly del trascrittoma/meta-trascrittoma

- Allineamento delle reads sul genoma di riferimento (o sul trascrittoma de novo) per identificare gli mRNA espressi

- Test statistico per l'espressione differenziale con visualizzazione grafica dei risultati

Annotazione funzionale del trascrittoma mediante:

- Identificazione della funzionalità dei trascritti

- Predizione della sequenza delle proteine

Attrezzature utilizzate

Cappa a flusso laminare

- Autoclave per sterilizzazione

- Sistema produzione acqua pura

- Microcentrifughe

- Incubatori

- Celle per elettroforesi su gel

- WorkStation e utilizzo di softwares “gold standards”

Responsabile/

Contatto

Dr. Angelina Lo Giudice

Tel: + 39 090 6015414

E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it