Conto Terzi
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Sede |
Messina |
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Laboratorio/ Strumento |
Laboratorio EcoBIM |
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Servizi erogati |
Caratterizzazione e identificazione ceppi microbici |
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Descrizione |
Tipizzazione ceppi batterici mediante analisi fenotipiche (saggi biochimici, fisiologici e morfologici); saggi di tolleranza ad antibiotici e metalli pesanti; identificazione microbica mediante analisi delle sequenze di specifici target (geni 16S rRNA e 18S rRNA, ITS rRNA); estrazione di acidi nucleici da colture pure. |
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Attrezzature utilizzate |
- Cappa a flusso laminare - Autoclave per sterilizzazione - Sistema produzione acqua pura - Microcentrifughe - Termociclatore - Incubatori - Specifici kit per l’estrazione degli acidi nucleici - Celle per elettroforesi su gel |
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Responsabile/ Contatto
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Dr. Angelina Lo Giudice Tel: + 39 090 6015414 E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it |
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Sede |
Messina |
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Laboratorio/ Strumento |
Laboratorio MAMB |
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Servizi erogati |
Analisi della comunità microbica mediante fingerprinting molecolare |
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Descrizione |
Ibridazione in situ (FISH e CARD-FISH) con sonde oligonucleotidiche specifiche |
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Attrezzature utilizzate |
- Microscopio ad epifluorescenza - Incubatori - Apparati da filtrazione |
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Responsabile / Contatto
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Dr. Angelina Lo Giudice e Sig.ra Giovanna Maimone Tel: + 39 090 6015414 E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it - giovanna.maimone AT cnr.it |
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Sede |
Messina |
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Laboratorio/ Strumento |
Laboratorio EcoBIM |
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Servizi erogati |
Analisi del genoma microbico |
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Descrizione |
Estrazione del DNA da colture pure. Ricostruzione dell’intero genoma mediante: - Assembly del genoma de novo o reference guidato - Visualizzazione grafica delle variazioni - Analisi degli effetti delle varianti sulla funzionalità proteica (predizione in silico) Identificazione di Single Nucleotide variants (SNVs) e piccole indels (inserzioni e delezioni di basi) Annotazione strutturale e funzionale del genoma mediante: - Identificazione di protein coding genes - Identificazione di rRNA e tRNA - Identificazione di eventuali elementi ripetuti e trasponibili nel genoma - Produzione di GFF e BED files |
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Attrezzature utilizzate |
- Cappa a flusso laminare - Autoclave per sterilizzazione - Sistema produzione acqua pura - Microcentrifughe - Incubatori - WorkStation e utilizzo di softwares “gold standards” |
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Responsabile/ Contatto
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Dr. Angelina Lo Giudice Tel: + 39 090 6015414 E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it |
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Sede |
Messina |
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Laboratorio/ Strumento |
Laboratorio EcoBIM |
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Servizi erogati |
Analisi metagenomiche |
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Descrizione |
Estrazione di acidi nucleici (DNA/RNA) da differenti matrici ambientali biotiche e abiotiche; analisi metagenomica target e whole genome mediante: - Classificazione delle specie allineando le reads al database - Analisi OTU clustering first o assignment first - Analisi filogenetica - Analisi comparative tra campioni |
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Attrezzature utilizzate |
- Cappa a flusso laminare - Autoclave per sterilizzazione - Sistema produzione acqua pura - Microcentrifughe - Incubatori - Celle per elettroforesi su gel - WorkStation e utilizzo di softwares “gold standards” |
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Responsabile/ Contatto
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Dr. Angelina Lo Giudice Tel: + 39 090 6015414 E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it |
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Sede |
Messina |
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Laboratorio/ Strumento |
Laboratorio EcoBIM |
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Servizi erogati |
Analisi del Trascrittoma |
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Descrizione |
Estrazione del RNA da colture pure Analisi del trascrittoma mediante: - Assembly del trascrittoma/meta-trascrittoma - Allineamento delle reads sul genoma di riferimento (o sul trascrittoma de novo) per identificare gli mRNA espressi - Test statistico per l'espressione differenziale con visualizzazione grafica dei risultati Annotazione funzionale del trascrittoma mediante: - Identificazione della funzionalità dei trascritti - Predizione della sequenza delle proteine |
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Attrezzature utilizzate |
Cappa a flusso laminare - Autoclave per sterilizzazione - Sistema produzione acqua pura - Microcentrifughe - Incubatori - Celle per elettroforesi su gel - WorkStation e utilizzo di softwares “gold standards” |
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Responsabile/ Contatto
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Dr. Angelina Lo Giudice Tel: + 39 090 6015414 E-mail: angelina.logiudice AT cnr.it |
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Sede |
Messina |
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Laboratorio/ Strumento |
Laboratorio MAMB |
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Servizi erogati |
Determinazione della biomassa procariotica |
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Descrizione |
Analisi digitale delle immagini ottenute dalle osservazioni al microscopio per la determinazione della biomassa dei procarioti mediante conteggio e caratterizzazione morfometrica e morfologica delle cellule. |
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Attrezzature utilizzate |
Microscopio ad epifluorescenza Zeiss AXIOPLAN 2 Imaging equipaggiato con videocamera digitale AXIOCAMHR (Zeiss) e software AXIOVISION 3.1. |
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Responsabile/ Contatto
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Sig.ra Giovanna Maimone Tel: + 39 090 6015423 E-mail: giovanna.maimone AT cnr.it |
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Sede |
Messina |
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Laboratorio/ Strumento |
Laboratorio MAMB |
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Servizi erogati |
Quantificazione di cellule con attività respiratoria |
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Descrizione |
Analisi digitale delle immagini ottenute dalle osservazioni al microscopio per la quantificazione delle cellule dotate di attività respiratoria (CTC+).
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Attrezzature utilizzate |
Microscopio ad epifluorescenza Zeiss AXIOPLAN 2 Imaging equipaggiato con videocamera digitale AXIOCAMHR (Zeiss) e software AXIOVISION 3.1. |
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Responsabile/ Contatto
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Sig.ra Giovanna Maimone Tel: + 39 090 6015423 E-mail: giovanna.maimone AT cnr.it |
L’Istituto può fornire prestazioni a pagamento, nel rispetto del vigente Regolamento per la Generazione, Gestione e Valorizzazione della proprietà intellettuale sui risultati della ricerca CNR, per le prestazioni in conto terzi (Ricerca contrattuale).
I laboratori dell’Istituto di Scienze Polari effettuano analisi chimiche, chimico-fisiche, microbiologiche, su varie matrici ambientali rilasciando il relativo attestato o relazioni tecnico/scientifiche.
Le analisi sono eseguite SOLTANTO DIETRO RICHIESTA inviata per email all’indirizzo del Referente di Laboratorio/Strumentazione e in cc al Direttore di Istituto (direttore.isp AT cnr.it) per la sede principale di Venezia e la sede secondaria di Padova e al Responsabile di Sede (responsabile_bo AT cnr.it; responsabile_me AT cnr.it; responsabile_rm AT cnr.it) per le sedi secondarie di Bologna, Messina e Roma, contenente nominativo, indirizzo e firma del Richiedente. Dovranno essere elencati le analisi da effettuare, il numero di campioni e tutto quanto si intende richiedere.
Per il solo fatto della presentazione della richiesta si intendono conosciute ed accettate dal Richiedente le norme e gli oneri conseguenti.
Successivamente al ricevimento della richiesta il Referente, ottenuto il nulla osta del Direttore/Responsabile di Sede, provvederà ad inviare un preventivo di spesa e ad indicare una data presunta di consegna dei risultati.
I campioni da analizzare dovranno pervenire, franchi di ogni onere, presso la sede del Referente secondo le modalità indicate nel preventivo.
Le tariffe che verranno comunicate si intendono al netto dell'IVA e comprendono l'esecuzione delle analisi e l’invio di una scheda contenente i relativi risultati. Non verrà fatta dal laboratorio coinvolto alcuna interpretazione e/o valutazione dei risultati delle analisi.
Ministero dell'Universita e Ricerca
Programma Ricerche Artico
Programma Nazionale di Ricerca in Antartide
Ministero degli Affari Esteri e della Cooperazione Internazionale
L'Italia e l’Artico
L’Italia e l’Antartide
CNR-ISP
Consiglio Nazionale delle Ricerche
Istituto di Scienze Polari
c/o Campus Scientifico - Università Ca' Foscari Venezia - Via Torino, 155 - 30172 VENEZIA MESTRE (VE)
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